Bagi umat Islam, terdapat 2 masjid kampus, yaitu Masjid Al-Hurriyyah di Kampus Dramaga dan Masjid Al-Ghifari di Kampus Gunung Gede, serta dilengkapi dengan mushola-mushola yang tersebar di seluruh fakultas.
Fasilitas gereja terletak di luar kampus dengan lokasi terdekat di Kecamatan Ciampea dan Kota Bogor. Sementara itu fasilitas pura dan wihara yang terdekat terletak di Kota Bogor.